Produce 101 Mùa 2 là chương trình tạo nên nhóm nhạc nam đầu tiên hợp tác giữa nhiều công ty sau Produce 101, chương trình gồm 101 thực tập sinh từ các công ty giải trí trong nước khác nhau của Hàn Quốc, và 11 thực tập sinh sẽ được chọn và thành lập nên một nhóm nhạc. Nhóm sẽ biểu diễn cùng nhau trong vòng 18 tháng dưới sự quản lí của công ty YMC Entertainment (cũng là công ty của I.O.I từ Produce 101 mùa 1). Top 35 thực tập sinh cũng sẽ biểu diễn cùng sân khấu với nhóm chiến thắng. Nhóm chiến thắng có thể sẽ tan rã và tham gia vào nhóm của chính họ trong khi công ty quản lí lên kế hoạch.

Nhiều công ty giải trí lớn bao gồm SM, YG and JYP đã không gửi thực tập sinh của mình tham gia Mùa 2. Tuy nhiên YG cũng đã gửi 4 thực tập sinh dưới danh nghĩa công ty con YG KPlus. Đạo diễn chính Han Dong Chul của Mùa 1 cũng đã rút khỏi chương trình do có những thỏa thuận kí kết riêng trong hợp đồng.